一、微生物实验室的组成
微生物实验室组成一般包括：准备室，微生物培养室，器械消毒及清洗室、纯水室、检测室、菌种室、储藏室等。微生物实验室根据工作领域（食品。药品、医疗等）和性质（教学、生产、研究、监测等）的不同，实验室组成和规模有很大的差别。
二、微生物实验室平面布局
微生物实验室应设置成独立的区域，与其他实验室分开，门口设有门禁，飞相关人员不得进入，各室根据工作内容合理布局，既方便工作又不互相影响。入口处设置集中更衣间，培养是根据培养条件和种类不同可设置多间（如霉菌培养室。细菌培养室、固体培养室、液体培养室等）。
1）洁净实验室：自成一区，安排在实验室的靠边角落处，用密封门限制人员的进出，把有洁净要求的房间设置在外部。考虑微生物试验操作流程，把检测室与消毒室和培养室相邻，方便人流与物流的分离。为控制人员的出入（人流），只设有一个密封门进入微生物实验室主洁净区，操作人员进入走廊然后进入准备间，并从准备间分别经过一更、二更、缓冲进入操作间。物流则由传递窗实现。排风口装有高效过滤器，送风口装有高效过滤静压箱，室内送排风采用上送下排的方式，室内排风单侧布置，不得有障碍。余压阀自动调节室内压力，保持正压洁净状态。
2）洗涤室：洗涤室房间的尺寸根据日常工作量决定，一般不小于一个单间，洗涤室的位置应靠近培养室，给排水设施完善，洗涤台面须耐热耐酸，室内配器皿柜、滴水架、干燥架、边台等，地面应有良好的排水坡度和地漏。
3）准备室：设实验台、试剂柜等要绝缘、耐热、实验台要耐水耐腐蚀；设置上下水装置，涉及粉碎，筛分等操作，须配置相应的设置。局部排风，设排风柜。
4）培养室：主要配置各种培养箱、摇床。要求温度较恒定，有足够的电力供应。
三、实验室设计与装修
1）必须为实验室安全运行、清洁和维护提供足够的空间。
2）实验室墙壁、天花板和地板应当光滑、易清洁、防渗漏并耐化学品和消毒剂的腐蚀。地板应当防滑。
3）实验台面应是防水的，并可耐消毒剂、酸、碱。有机溶剂和中等热度的作用。
4）应保证实验室内所有活动的照明，避免不必要得反光和闪光。
5）实验室器具应当坚固耐用，在实验台、柜和其他设备之间及其下面要保证有足够的空间一边进行清洁。
6）应当有足够的储存空间来摆放随时使用的物品，在实验室的工作区外还应当提供另外的可长期使用的储存空间。
四、实验室安全设施
有足够的通风装置，每小时至少换气6次。有火警系统、应急用的灭火器、灭火毯，火灾监测系统运行良好。消防门及标识良好。专用储存柜来储存易燃物品，有易燃物品/防止火灾标记。